从性质来讲，农行是国家级的，农商行是地方性质的，而且是由农村信用社改制而来的。从布局来讲，农行是遍布国内外的，农商行只布局了我国26个省、自治区以及4个直辖市。资产规模也大相径庭，截至2018年，农行资产规模达21.05万亿元，截至2016年底,全国农商银行资产规模20.2万亿元。另外，很多农行的业务，农商行是做不了的。

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中国农业银行（以下简称农行）曾是国有独资商业银行，农信社与农行是脱离行政隶属关系的，后由国有独资商业银行整体改制为股份有限公司，是我国五大行之一（中农工建交）。

农村商业银行，简称：农商银行，是由辖内农民、农村工商户、企业法人和其他经济组织共同入股组成的股份制的地方性金融机构。农村合作银行要全部改制为农村商业银行。

中国农业发展银行是直属国务院领导的中国唯一的一家农业政策性银行。（政策性银行是指由政府创立，以贯彻政府的经济政策为目标,在特定领域开展金融业务的不以盈利为目的的专业性金融机构。实行政策性金融与商业性金融相分离）主要职责是按照国家的法律法规和方针政策，以国家信用为基础筹集资金，承担农业政策性金融业务，代理财政支农资金的拨付，为农业和农村经济发展服务。